第294章 下一步实验目標

  “第一条线，年前那个耐盐碱水稻的课题，核心论文发了，但后续还有一些收尾工作。中科院遗传所那边已经拿到了第一批秈稻的转化材料，我们需要配合他们做几组功能验证。这部分工作量不大，但数据质量要保证。李鑫，这一块还是你负责，有问题吗？”

  顾明教授將目光望向了旁边的李鑫。

  “没问题。”李鑫回答得很乾脆。

  “第二条线，我跟赵阳討论之后，决定开一个新方向。”

  顾明翻开笔记本的另一页。

  “这次不搞简单的功能验证了，我们试著把组学分析和网络建模引入进来。就是利用我们已有的转录组数据，构建水稻耐盐性相关的共表达基因调控网络，找到核心调控模块，然后对这些模块进行生物学功能验证。”

  他说完看了赵阳一眼。赵阳站起来走到白板前，拿起马克笔在上面画了一个简单的调控网络逻辑图。

  他先从技术角度解释了一下怎么用加权基因共表达网络分析来筛选候选调控模块，然后把这些模块映射到已经验证过的几个关键转录因子上，最后在nac家族转录因子的位置上圈了一下，说这可能是整个调控网络里的一个核心枢纽节点。

  李鑫看完举手问了个问题：“这个网络的可靠性怎么验证？光靠统计模型算出来的相关性，在生物学上不一定有意义。”

  “对。”

  赵阳在节点和连线之间又画了几条虚线。

  “所以网络只是第一步，给我们一个缩小范围的方向。筛选出候选模块之后，还是要回到实验台上来做功能验证。这次可以尝试用基因沉默和过表达两种手段同时验证。如果某个模块的核心基因被沉默之后耐盐性明显下降，或者过表达之后耐盐性提升，就能確认它在调控网络中的地位。”

  李鑫若有所思地点了点头。旁边几个研二的学生也纷纷在笔记本上记了几笔。顾明看大家对这个课题都有兴趣，便开始分配具体任务。

  “网络构建和分析这部分，由赵阳来主导。顾青辅助，主要负责数据清洗和可视化。功能验证部分，李鑫你的经验比较丰富，带两个师弟师妹来做。引物设计和载体构建这块，周婷负责。每个小组每周至少给我匯报一次进展，具体时间你们自己商量定。”

  组会结束后，大家三三两两散开，各自回实验台准备新学期的工作。赵阳把白板上画的那几个草图拍了下来，存进手机里，准备回去之后整理成一份更完整的实验方案发给组里。